企业员工请假扣款的会计分录为:借:库存现金(银行存款)，贷:营业外收入，如果扣款是从工资中扣除的话，则:借:应付职工薪酬，贷:营业外收入。
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职工薪酬，是指企业为获得职工提供的服务或解除劳动关系而给予的各种形式的报酬或补偿。职工薪酬包括短期薪酬、离职后福利、辞退福利和其他长期职工福利。企业提供给职工配偶、子女、受赡养人、已故员工遗属及其他受益人等的福利，也属于职工福利。
“职工”是指与企业订立劳动合同的所有人员，含全职、兼职和临时职工，也包括虽未与企业订立劳动合同但由企业正式任命的人员。未与企业订立劳动合同或未由其正式任命，但向企业所提供服务与职工所提供服务类似的人员，也属于职工的范畴，包括通过企业与劳务中介公司签订用工合同而向企业提供服务的人员。
工资业务用应付职工薪酬科目进行归集,各项扣款根据情况计入对应科目,从应付职工薪酬中扣除。具体会计分录为:
借:成本费用科目(根据工资受益对象确定)
贷:应付职工薪酬-工资
2员工迟到扣款如何做会计分录
1.以罚款通知做分录
借:其他应收款
贷:营业外收入
2.发工资扣除时
借:应付职工薪酬
贷:其他应收款
3.做工资分录时，先计入往来
借:管理费用
贷:应交税费-个税
贷:其他应付款-罚款
贷:库存现金
然后再按照罚款的性质，再从往来转入或冲减相关科目。
值得一提的是，用人单位规定的有效的罚款措施，应是属于在劳动法允许的范围内，采取的与违纪者的违纪行为相适应的相当于违约金的处罚措施的，只是字面上表述为“罚款”。另外，行政机关的罚款是从行政角度而言的，是以国家的强制力作为保证的。被罚款的人如果不服，可以申请行政复议或向法院提起行政诉讼，但不停止罚款的执行。企业的罚款是从企业管理的角度而言的，是对职工违反劳动规章制度时经济上的惩罚。职工不服的，有申辩权，还有向劳动仲裁部门提起仲裁的权利。
3计提工资怎样做会计分录
1.计提工资
借:××费用(管理/销售等)
贷:应付职工薪酬——工资
2.计提社保(企业部分)
借:××费用(管理/销售等)
贷:应付职工薪酬——社保
3.次月发放工资时
借:应付职工薪酬——工资
贷:应付职工薪酬——社保(个人部分)
应交税费——应交个人所得税
库存现金/银行存款
4.上交杜保
借:应付职工薪酬——社保(企业部分+个人部分)
贷:库存现金/银行存款
5.上交个人所得税
借:应交税费——应交个人所得税
贷:银行存款